Το Τμήμα Γ’ Ευρωπαϊκών Προγραμμάτων είναι αρμόδιο για:

• την εποπτεία υλοποίησης και εφαρμογής προγραμμάτων της Ευρωπαϊκής Ένωσης και τη σύνταξη της ετήσιας διαβεβαίωσης επί της υλοποίησης των προγραμμάτων
• τη συστηματική ενημέρωση κοινής βάσης δεδομένων για τα προγράμματα, τις πρωτοβουλίες και τα χρηματοδοτικά μέσα της Ευρωπαϊκής Ένωσης και άλλων περιφερειακών Οργανισμών που δραστηριοποιούνται στην Ευρώπη
• την υποστήριξη των υπηρεσιών και των φορέων στην κατάρτιση και υποβολή προτάσεων σε Ευρωπαϊκά Προγράμματα, αυτοτελώς ή σε συνεργασία με άλλους φορείς
• την υλοποίηση δράσεων προγραμμάτων σε συνεργασία με τους συναρμόδιους φορείς
• την εποπτεία, καθοδήγηση και υποστήριξη των αρμόδιων δομών ως προς την εκτέλεση των ευρωπαϊκών προγραμμάτων στον τομέα της Εκπαίδευσης και της Κατάρτισης,
• την υποβολή σχεδίων στην Ευρωπαϊκή Ένωση, με στόχο την προαγωγή της εθνικής πολιτικής για την Εκπαίδευση και την Κατάρτιση
• τον χειρισμό κάθε άλλου συναφούς θέματος.